Selon l’OMS, les probiotiques sont des bactéries vivantes qui lorsque consommées régulièrement et en quantité suffisante, exercent un effet potentiellement bénéfique sur la santé.

Nous assimilons nos premiers probiotiques à la naissance, quand nous passons par les voies naturelles de notre maman. Avant notre naissance, notre tube digestif est stérile, puis à la naissance, nous allons capter par la bouche, un petit échantillon des bactéries vaginales et intestinales de notre maman. Ces bactéries vont ensuite coloniser notre tube digestif et se développer tout au long de notre vie. Nous commençons donc avec en théorie, la meilleure combinaison de bactéries pour la nourriture de notre maman, donc la nôtre après notre sevrage.

Notre microbiote va ensuite évoluer en permanence au cours de notre vie, en fonction de notre alimentation, de notre style de vie ou de nos médicaments. Plusieurs facteurs peuvent avoir des effets néfastes sur le microbiote avec des conséquences plus ou moins grâves sur la santé. Une cause de déréglement est le stress chronique. Une autre cause majeure est le traitement par les antibiotiques. Certains antibiotiques à large spectre vont quasiment exterminer toutes les bonnes bactéries de notre colon. Cela va faire la place et permettre à certaines mauvaises bactéries de proliférer. Un exemple de ces mauvaises bactéries est le Clostridium difficile (en latin donc prononcez difficilé). Comme en plus ces Clostridium vont devenir résistants aux antibiotiques, il sera très difficile de s'en débarasser. Cela peut avoir des effets grâves chez l'adulte, mais dramatiques chez l'enfant, dont le cerveau en plein développement. Il a été montré que la prescription répétée d'antibiotiques chez des jeunes enfants, pour des otites à répétition, par des médecins négligents, va sélectionner ces Clostridium. Une étude récente de 2020 a montré que ce Clostridium difficile est présent dans les selles des enfants autistes et absent dans les selles des enfants témoins.

Dans la plupart des cas, un dérèglement du microbiote peut se réparer spontanément, avec une alimentation adaptée, riches en fibres et un style de vie sain et actif. Dans d'autres cas, on peut avoir recours à des probiotiques. Ces traitements par des probiotiques, consistent à prendre pendant quelques jours à quelques semaines, des gelules de bactéries vivantes (lyophilisées) en très grandes quantité. Un exemple de ces gélules est le PROBIO FORTE à ce lien. Ces gélules contiennent chacune 8 Milliards de bactéries. Beaucoup d'autres marques contiennent moins de bactéries et sont souvent peu efficaces.

Cependant, une autre étude récente de 2021 a mis en évidence que la prise de ce type de probiotiques peut être délétère dans certaines situations, en réduisant l'efficacité de traitements immunothérapeutiques contre le mélanome. Il convient donc de réserver leur usage à des situations ponctuelles, visant à restaurer à court terme la flore intestinale après un traitement antibiotique aggressif ayant induit une gêne intestinale de type diarrhée profuse prolongée.

Une autre méthode décrite en 2021 pour enrichir son microbiote en "bonnes bactéries" comme Akkermensia ou Ruminococcaceae , serait un jeûne de 5 jours suivi d'une alimentation riche en fibre. 

Enfin, dans les cas grâves et persistants, quand le microbiote est déréglé de manière irréversible, on pratique maintenant des "transplantations de caca", en préparant des suspensions de bonnes bactéries, issues du microbiote d'une personne en bonne santé, puis injection directe par intubation dans l'intestin grêle.

Mais il ne suffit pas d'avoir un bon microbiote de départ, ou de se faire transplanter le bon microbiote d'une personne en bonne santé. Il faut aussi entretenir soigneusement ces bactéries en leur donnant à manger. Un peu comme un bon jardinier qui va prendre soin de ses plantes pour qu'elles se portent au mieux.

La nourriture du microbiote sont les prébiotiques.

Le terme prébiotique regroupe un ensemble de glucides complexes qui ne peuvent pas être assimilés par notre intestin et vont donc être disponibles pour nos bactéries intestinales.

On parle alors de fibres solubles. Le terme n'est pas juste car ce ne sont pas vraiment des fibres, puisqu'elles sont solubles. Les vrais fibres sont insolubles, ne sont digérables ni par nous ni par nos bactéries, et ont donc surtout un rôle mécanique sur le transit intestinal. Il est bien d'en manger une certaine quantité chaque jour, mais un excès peut avoir un effet irritant sur le colon.

Les fibres solubles donc, que nous appelerons donc plus justement les prébiotiques, sont principalement des glucides complexes, dont la structure ne peut pas être décortiquée par nos enzymes digestives comme l'amylase, qui sait très bien décomposer l'amidon (un autre glucide complexe présent dans le blé, les patates, etc) en glucose. Il vont donc arriver intacts aux bactéries, qui ont elles des tas d'enzymes différentes pour découper ces glucides "complexes". 

Ces prébiotiques sont des amidons résistants (polymères de glucose), présents dans certains grains entiers, féculents, légumineuses et patates. Ce sont aussi des "fibres" de parois végétales, comme la cellulose ou la pectine, présents dans les fruits et légumes. Enfin, ce sont aussi des oligosaccharides comme les FOS, GOS et XOS et AXOS. FOS veut dire Fructo-oligosaccharides, et sont présents dans l'ail, l'oignon, l'échalotte, les topinambours, les artichauts, les poireaux, les choux, choux-fleurs, choux de Bruxelles, pissenlit, igname, agave bleue, jicama, okra et bananes vertes . GOS veut dire Galacto-oligosaccharides. Ils sont présents dans les laitages et favorisent le microbiote du bébé, Les XOS ou AXOS veulent dire Xylose or Arabinose-Xylose-Oligosaccharides et sont présents dans le son de blé.

Et c'est là, qu'une fois encore, notre alimentation industrielle va avoir un effet doublement néfaste. En raffinant à l'extrème les glucides, on obtient une nourriture ultra-transformée, qui est bourrée de glucides raffinés qui vont faire grossir en déclenchant des pics de glycémie puis d'insuline gigantesques, et donc une prise de poids inexorable, et quasiment dépourvue de glucides complexes pour nourrir nos vielles amies. Notre microbiote va donc être affamé, va perdre sa biodiversité et son fitness, entrainant un spirale infernale car on sait maintenant qu'un microbiote détraqué va non seulement influencer notre moral et notre immunité, mais aussi notre poids et notre métabolisme.

Vous trouverez à ce lien un petit article qui résume les probiotiques et les prébiotiques.